מי שתרם תרומה לעמותה מוכרת לצורך ההטבה, ותרומותיו טרם עודכנו במערכת תרומות ישראל, יוכל להזדכות על התרומה בתיאומי המס ככל והעמותה תעדכן את תרומותיה במערכת תרומות ישראל לפני תום השנה. אם התרומות לא יעודכנו במערכת עד סוף השנה, ניתן יהיה לקבל את הזיכוי באמצעות בקשה להחזר מס או דוח שנתי בתחילת השנה שלאחר מכן, בצירוף סריקה של הקבלות שלא דווחו במערכת.
בגין תרומות שדווחו במערכת המקוונת, ניתן יהיה לבצע תיאום מס מספר פעמים בשנה ללא מגבלה, ולהזדכות גם על תרומות שנתרמו על ידי בן או בת הזוג, כל עוד דווחו במערכת. כאמור, הדיווח במערכת המקוונת חוסך לתורמים את הצורך לאסוף קבלות ולהציגן בתיאום המס. האישורים על התרומות מעודכנים כבר באזור האישי וניתן לראות אותם כאשר נכנסים למערכת תיאומי המס המקוונת.
מערכת תרומות ישראל פותחה על ידי רשות המסים על מנת לאפשר פיקוח יעיל והדוק יותר על כספי תרומות שמגיעים לעמותות המחזיקות באישור להטבות מס, ולהקל על הציבור למצות את הטבת המס בגין תרומה. החל מה-1 בינואר 2026 ידרשו כל העמותות המחזיקות באישור לפי סעיף 46 לפקודה לדווח במערכת על התרומות וביטולי התרומות שלהן.
במסגרת המהלך פותחה גם אפשרות לקבל את הזיכוי במס בגין התרומה ישירות דרך תלוש השכר. כדי לעשות זאת, המעסיק צריך לוודא שתוכנת השכר התממשקה למערכת תרומות ישראל והעובד צריך לתת למעסיק אישור באזור האישי שלו באתר רשות המסים, לקבל את סכום התרומות שתרם לצורך מתן זיכוי המס. המעסיק יקבל מידע הכולל סכום מצטבר של תרומות, אשר לא יכלול מידע על פרטי העמותות להן תרם העובד.
